Angel Beats! raconte l'histoire de Otonashi, un jeune homme qui se réveille dans un monde mystérieux où il est entouré d'autres adolescents qui ont tous un passé douloureux. Ces adolescents sont morts et se sont réunis dans ce lieu appelé l'école du Monde Afterlife. Ils forment un groupe rebelle appelé SSS qui se bat contre la mystérieuse Angel, qui dirige l'école. Otonashi se joint à SSS et découvre qu'en dépit de leur passé douloureux, ces adolescents sont unis par leur désir de trouver le bonheur. Alors que le groupe se bat pour leur liberté, Otonashi et ses amis découvrent le vrai but de leur existence et leur destinée.
