Cette histoire se déroule sur une île lointaine. Un jeune garçon nommé Clain va découvrir une jeune fille blessée, qui disparait mystérieusement, ne laissant derrière elle qu'un pendentif. Clain décide donc de partir, dans le but de retrouver cette mystérieuse fille du nom de Phryne. Il découvrira les secrets concernant le système Fractale se trouvant sur cette île.
